槍神記講述了基因鎖作為一項神秘降臨的超時代科技，它能促使人體機能在速度、力量、感官等得到空前強化。成功打開基因鎖的人成為新時代的“特工”，而特工中的佼佼者們被稱為——“槍神”。圍繞基因鎖這一新型軍備，各勢力激烈鬥爭，紛紛成立學院培育特工。隨著實驗的突破與應用，同時來自神秘種族的脅迫，更讓世界逐步陷入戰爭的泥沼...戰亂結束之後，神秘種族消逝殆盡，特工、槍神更成為無從證實的都市傳說，僅剩的兩大特工組織“深海”與“荒蛇”分別將基地遷移至海底和地下，互不相擾。然而一派和平景象下，實則危機四伏。