寶島での激戦を終え、無事に科學王國へと帰還した千空たち。 手に入れた石化裝置で、コールドスリープしていた司を復活させることに成功。司は科學王國の仲間となった! そして、人類石化の黒幕・ホワイマンの本拠地が“月”であることを突き止めた千空たちは、月を目指す! このストーンワールドで、ゼロから宇宙船を作るビッグプロジェクトへと乗り出した。 早速、世界中から宇宙船の素材を集める為、ペルセウス號で大海原へと飛び出した千空たち。 復活液の原料となる大量のコーンを求め、最初の目的地・アメリカ大陸を目指す。 勇気、結束、科學力、全てが試される大航海の先に、千空たちを揺るがす脅威が待ち構えていた――!! 遂に、千空たちの冒険は世界、そして宇宙へ向けて動き出す! 人類の未來を救う為、千空は仲間と共に全力で科學の道を切り拓いていく!!