《全金屬狂潮劇場版》動畫內容為全金屬狂潮第1季導演剪輯版，共3部。 在20世紀，世界格局比較穩定的時候，各大國都想增強自己的軍事力量，從而稱霸世界。而Whisper[耳語者]這種特殊的人類，自從出生開始就擁有特殊的能力，不用學習也能知道超越當時科技幾十年的被稱為黑科技的高科技手段。為了保護世界格局的穩定，神秘組織Mithril[米斯利爾]派出了相良中士等三人去保護一名已知的Whisper[耳語者]，即千鳥香奈。其中相良中士裝成轉校生隨時跟蹤保護，由於長期處於軍隊的生活，完全沒有普通高中生的生活常識的相良中士在學校里鬧了不少笑話。在學校期間也發生了不少恐怖的事情，如蘇聯為綁架香奈制造的劫機事件等。宗介和千鳥之間也因為發生的各種事件產生了特殊的感情……