1982年の第1巻発売以來、シリーズ計15巻で1500萬部を売り上げ、過去にアニメ化もされた田中芳樹の大長編SF小説「銀河英雄伝説」を、Production I.Gの制作で新たにアニメ化した「銀河英雄伝説 Die Neue These（ディ・ノイエ・テーゼ）」のセカンドシーズン第3章。2018年放送のファーストシーズン「邂逅」（第1～12話）に続くセカンドシーズン「星亂」（第13～24話）は、全12話を4話ずつ全3章にわけて劇場上映する。帝國暦488年8月、銀河帝國の辺境ヴェスターラントで領民に対して行われた大量虐殺。それを事前に知りながら看過したことで、ラインハルトと盟友キルヒアイスの間にはじめて亀裂が生じる。同じころ、クーデターを引き起こした「救國軍事會議」の勢力下にあった自由惑星同盟の首都ハイネセンは、ヤン・ウェンリーによって攻略され、クーデターは終結するが……。