光頭強爸爸突然到訪狗熊嶺,向來嚴厲古板的強爸卻對光頭強噓寒問暖,而朝夕相處卻未能緩和關系,反而導致了父子矛盾的爆發……在一次激烈的爭吵中,光頭強和兩熊被“縮小機”意外縮小,毫不知情的強爸傷心離開,並無意間帶走了“縮小機”。於是,光頭強和兩熊踏上了追趕強爸和機器的“微觀世界”冒險之旅。與此同時,一名陌生國外女記者突然出現,並頻頻出沒於大馬哈魚生活的河域附近,舉止神秘,牽出了一系列神秘事件……