電視動畫《科學超電磁炮》以鐮池和馬所著的輕小說《魔法禁書目錄》中的人氣角色御阪美琴為主角的同名外傳漫畫改編的動畫。 在面積占據東京都西部的三分之一,居住著230萬名人口,其中八成人口是學生的巨大都市“學園都市”中,學園都市和外部隔離,研究最尖端科技。所有學生都接受超能力開發,並大都借由藥物、催眠術與通電刺激等方式取得超能力。有各種類型不同能力,以範圍和威力分為無能力者、低能力者、異能力者、強能力者、大能力者和超能力者。故事從學園都市最強的電擊公主“超電磁炮”御阪美琴,某天認識了和白井黑子一樣擔任風紀委員的初春飾利開始……